El miserere narra la historia de un peregrino, músico de profesión, que quiere componer un miserere único y perfecto para que Dios perdone sus pecados. Es así como encuentra un monasterio donde le cuentan la leyenda de los fantasmas de unos monjes que entonan un miserere sobrenatural en las noches. Esta leyenda se puede relacionar con La rosa de la pasión, otra de las obras de Bécquer....